Arcana Heart 3 продолжила геймплейные традиции двух первых частей. Ключевые особенности серии — на 100% женский коллектив играбельных персонажей и возможность перед сражением выбрать «аркану», то есть магическую стихию. Она напрямую влияет на арсенал умений и предоставляет простор для экспериментов. В третьей части появилась аркана крови, мощный и опасный инструмент.
Сюжет рассказывает о фэнтезийной Японии будущего. Пока страна восстанавливается от пространственно-временного разлома, произошедшего в регионе Канто, к власти пытаются прорваться могущественные религиозные организации. Борьба проходит на фоне возникновения новых разрушительных порталов.
Выразительная приписка к названию относится к одноимённому обновлению. С ним игра пришла в тот вид, в котором находится сейчас, а ростер бойцов пополнили три уникальных героя — изначально их планировали продавать отдельно.